公司能扣除员工银行卡的工资吗？

不可以，如单位存在克扣工资情况，劳动者可以向劳动监察部门举报投诉，也可以向劳动仲裁申请仲裁。如以用人单位克扣工资为由解除劳动合同，用人单位还需向劳动者支付解除劳动关系经济补偿金，标准为按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

《中华人民共和国劳动合同法》 第四十七条 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。 劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。 本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。